ついに来ましたね!ギガ対セイスモ！凱龍輝が出るまでは多分旬な話なので早速…
バトストではセイスモに軍配が上がりましたが、一概にセイスモが強いとは言い難いので両方のファンブックや機体データを基にお話したいと思います。

まずは両機の機体サイズ。キットを持っている人は並べるとわかりますが、セイスモは長さだけでボリューム的にはギガの方が圧倒的にあります。データを見れば一目瞭然、重量ではギガ（200ｔ）に対しセイスモ（198t）、ウルトラやデスザウラーと比べると軽いんです。性能面からは判りづらい所があるかも知れませんが、機体などの基本データでは両機に大差がないと考えてよいのではないでしょうか?
あぁ、セイスモのサイズが…以下省略。

さて、以降は個人的な意見をします。
ギガは被弾によるダメージを和らげるためにエネルギーのほとんどをハイパーEシールドに使うのではないでしょうか?　そのためにエネルギー消費系の武器を装備できないのであれば、全エネルギーを荷電粒子砲などにまわせるセイスモには砲撃力では当然及ばないと思います。
しかし、ハイパーEシールドを展開された場合、圧倒的なセイスモの砲撃力もそのほとんどが無力化します。唯一通用する兵器のゼネバス砲も長距離からであればNOVOさんのおっしゃられる通り本能で避けることも可能ではないでしょうか?

砲撃戦で及ばない反面、格闘戦ではギガが大きく凌駕します。再び比べることになりますが、ギガの口はかなり大きいです。それこそセイスモの顔から首ブロック1個分くらい余裕に口でくわえるくらい（実験済み）。バトストではゼネバス砲の零距離射撃を受けましたが、ギガの機動性の高さを考慮すると、荷電粒子収束中に首そのものを食い千切ることも可能ではないでしょうか?　また、ロケットテイルでなぎ払えば装甲を破壊することができるだろうし、シールドアタックみたいな技が使えるならそれこそ楽勝モノでしょう。ちなみにセイスモにも格闘能力は備わっているみたいですが、鈍重なセイスモの攻撃が役に立つかは疑問です、それはアルセイになっても同じこと。

僕はギガ派なので言いたい放題言ってしまいましたが、実際は長距離攻撃のできるセイスモの方が有利なのは変わりません。ただ、戦場を暴れまわるギガ（予想）を一ヶ所に引き止めることができるゾイドが帝国に少ないことを考えるとセイスモがギガを一撃で仕留める事やギガの完全な無力化は難しいのでは?