うーん…最近は「限定版=定価より高額」というのが通説になんですかね?　ゾイドの限定キットなんか「値段が高い!」の一言に尽きますし、正直出し過ぎの感じがありません?

僕もパーなおつむで考えたのですが、値段が高くなるのはやはり…
1.コラボだから?
コラボレーションとは共同制作、合作といった意味です。妄想シリーズはハピネット、ブラデスやプロトギガはドリプロがTOMYとコラボって限定モノを出してるわけです。つまり、一つの商品に二つの会社の利益が関わってくるので値段が上がるのではないかと思います。
2.原価が高くなるから?
限定モノの定番ともいえる色違いですが、これも値段を上げている原因かもしれません。というのも、本来の成型色以外の色を使うことで新たに材料費が必要ですし、限定モノの場合、製造数が限られているため（実際は不明）製造原価が高くなり、結果利益を加えるとさらに高くなるのではないでしょうか。
ブラデスが2,000円高いのはこれらの結果だと思います。僕的にはあれの成型色の赤は非常に美麗に感じました。持ってないので再販して欲しいです。
3.買う人がいるから?
最終的には買う人（買ってしまうひと）がいるから無茶な限定モノラッシュや商品の高額化も実現してしまうのでは?　僕もこの中の一人なので何ともいえませんが、一定ラインを下回らない限り、限定モノ企画はなくならないと思います。それにしても限定キットを複数買う人って凄いですよね、やっぱりオークションに出すのが目的なんですかね?
ついでですが、デスピオンが高いのはパンツァーティーアシリーズの布石としての役割が大きいのではないでしょうか？

値段の高さなど不満な点はいくつかありますが、全体的に限定モノは賛成です。でも願わくば新規パーツやコロコロ限定ゾイドの再販を組み合わせてもらえるといいですね。
最後に限定モノとして一つ。皆さんご存知かと思いますが9月25日発売の電撃ホビマガ・11月号には限定ブロックス・ブリッツホーネットが付属するそうです。電撃だけにBLITZ!（電撃的）